En el Salón de hongos se estudia el rol de los microorganismos en la descomposición y el reciclaje de nutrientes. El lugar incluye exhibiciones que permiten evaluar la diversidad de estos grupos microbianos descomponiendo diferentes materiales naturales y artificiales. Este salón fue diseñado por el Arquitecto Ricardo Medina y construido con el apoyo del Ing. Alexis Massol. La morfología de sus bancos está inspirada en las lombrices de tierra que también contribuyen a la descomposición de materia orgánica en el bosque. La técnica de construcción incluye una mezcla de arena, arcilla seca y cemento apisonada en capas.